差異表達基因分析[轉載]
轉自:https://wenku.baidu.com/view/2532ab5176c66137ef06191a.html
1.轉錄組
2.轉錄組研究重要性
3.轉錄組研究技術
3.1三種的比較
3.2技術比較
4.高通量測序技術的應用
5.轉錄組資料分析
6.差異表達基因分析
4.1FC法——差異表達倍數法
那麼也就是說A與B是2倍的關係。
4.2卡方檢驗
7.假設檢驗存在的問題
7.1 t檢驗差異基因
我終於知道是怎麼進行t檢驗找差異表達基因了,應該是聚類之後單細胞被確定為不同的細胞型別,那麼將這些細胞型別子集中的每一個基因表達抽取出來,對每一個基因來說
7.2方差分析
8.趨勢性上調或者下調
我的理解是,在判斷差異基因的時候,調整FC的閾值,胡總和是相關係數的閾值,這樣就會有得到更多或者更少的差異表達基因。
9.GO分析
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