1. 程式人生 > >長生不老:從秦始皇到基因編輯

長生不老:從秦始皇到基因編輯

2018年11月26日,賀建奎宣佈,一對名為露露和娜娜的基因編輯嬰兒於11月在中國健康誕生。其實賀建奎的辦公室,就是在深圳,在這個創新的城市,我一點不感覺到奇怪。這幾天,對於這個話題非常火,這個訊息就像第一顆原子彈爆炸,其實不亞於原子彈的影響,為什麼這樣說呢,因為基因工程是一個最熱門的課題,也是當前最有前途的技術。因為這個技術改變的世界,並且與以往的技術不一樣,如果把以往的技術,比如自動化、電腦、手機、高鐵這樣的技術叫做“軟體”,那麼基因編輯就是相當於資訊科技裡的“硬體”。以往的技術都是把人以外的技能進行擴充套件和加強,相當於不斷地升級軟體,安裝更多的軟體,但基因編輯就相當於電腦裡的CPU,要對這個人類的“硬體”進行升級換代了。我們現在這一代人的基因就相當於8086的CPU,下一代就是80186,這樣不斷一代一代地升級下去,直到686等等。那麼為什麼人類需要基因編輯呢?

如果你去過西安旅遊,肯定會去參觀過兵馬俑,看到一個個像真人一樣的陶俑,這支古代的軍隊一直守衛著一名豐功偉績的皇帝--秦始皇,他不但統一六國,還制定很多統一的政策,比如統一的貨幣,這樣開創全國的自由貿易。由於他開創了一統的天下,他認為自己就應該長生不老,永遠管理下去。因此,公元前219年,秦始皇曾坐著船環繞山東半島,在那裡他一直流連了三個月,在那裡他聽說在渤海灣裡有三座仙山,叫蓬萊、方丈、瀛洲。在三座仙山上居住著三個仙人,手中有長生不老藥。告訴秦始皇這個神奇故事的人叫徐福,他是當地的一個方士,聽說他曾經親眼看到過這三座仙山。秦始皇聽後非常高興,於是就派徐福帶領千名童男童女入海尋找長生不老藥。徐福帶領的浩大的艦隊出發了,但他在海上漂流了好長時間也沒有找到他所說的仙山,更不用說是長生不老藥。秦始皇是個暴君,徐福沒有完成任務,回去後依秦始皇的作風一定會被殺頭,於是他就帶著這千名童男童女順水漂流到了日本。可見,秦始皇在當時被騙了,並沒有找到長生不老藥。不過這個找長生不老藥的夢想一直留下來了,後面很多皇帝都在尋找,比如道教的修仙丹,練丹又分為兩種內丹和外丹,所謂的內丹,就是通過吐氣汲納凝結而成。外丹就是通過玉石練制而成,比如明朝的嘉靖

皇帝就經常吃外丹。其實內功心法很難突破人類的基因,因為基因都是分子結構,要打破分子鍵,需要比較大的能量才可以,並且不能有針對性地修改。外丹的方法其實就像目前的化療,希望通過化學藥物的方式來修改人類的基因,同樣沒有定向性,同時還會傷害很多正常的細胞,把人的壽命更加縮短了。

通過歷史來回顧,化學的方法沒有定向地修改基因,物理的方法其實也行不通。雖然物理的方法在育種方面有很大的進步,比如把種子放到紫外線下面進行照射,這樣通過量子效應就可以把植物的基因進行修改,因為紫外線提供的光子有很大的能量,可以把原子裡的電子進行激發到更外層的空間,這樣分子之間的化學鍵就會產生變化,從而形成同分異構體,也就是產生了新的物質,因而改變了基因,不過這些基因的改變是隨機的,不能定向編輯。由此可見物理、化學的方法都行不通,因為它具有隨機性。那麼還有其它方法嗎?

隨著生物科學的發展,對人類這個硬體進行升級越來越快了。經過多年的研究,人們發現人的黑頭髮,藍眼睛都是通過基因來遺傳的。人是由大量細胞組成,而細胞中最重要部分是細胞核,在細胞核中又有一個重要的物質叫做DNA,DNA是一種有機物大分子,又叫脫氧核糖核酸,是生物的遺傳物質。有時被稱為“遺傳微粒”,因為在繁殖過程中,父代把它們自己DNA的一半複製傳遞到子代中,從而完成性狀的傳播。DNA分子的雙螺旋結構是相對穩定的。這是因為在DNA分子雙螺旋結構的內側,通過氫鍵形成的鹼基對,使兩條脫氧核苷酸長鏈穩固地並聯起來。另外,鹼基對之間縱向的相互作用力也進一步加固了DNA分子的穩定性。鹼基對就是構成了遺傳資訊的編碼,不同的鹼基對排序組合,就可以形成不同的編碼,生物上把這小一段具有不同特性的編碼叫做基因,比如那一段對應大眼睛,那一段對應雙眼皮,那一段對應色盲。但是鹼基只有4種類型:A\G\C\T,並且這幾個還有一種互補的關係,比如A和T對應,C和G對應,也就是說只要發現A,那麼對面的另外肯定是T。生物就是通過這種編碼來構造不同的特性,那麼DNA又是怎麼樣來指導細胞組成外表的呢?其實DNA不是直接控制蛋白質生成,它是先把DNA上的資訊轉錄到單鏈的RNA上,RNA就可以從細胞核裡跑出來,到外面蛋白質工廠來生成與DNA一樣的蛋白質,這樣就可以把遺傳資訊轉成實物蛋白質了。 蛋白質(protein)是生命的物質基礎,是有機大分子,是構成細胞的基本有機物,是生命活動的主要承擔者。可以說沒有蛋白質就沒有生命。因此這樣就可以形成各式各樣的人出來,看到黑頭髮,藍眼睛等等特徵。

既然DNA有這麼重要,那麼只要找到一種方法可以把DNA進行修改,就可以改變人的功能,比如長生不老,讓人自己的細胞可以不斷地自我修復,也就是把老化的器官重新再長一個出來,或者把老化的器官進行修復,不讓器官的細胞老化。比如你的心臟血管老化了,那麼就可以把你的基本編輯一下,再注入去讓它重新把血管生成新的。

科學家一直在查詢這種編輯基因的方法,但是不是很順利,因為以往的技術只能讓基因損壞,而不能增加基因進去。隨著時間流逝,越來越沒有信心的時候,突然在1987年,日本科學家在大腸桿菌的基因中發現一些不同尋常的重複性序列,他對細菌這麼細的生物裡有重複的基因序列感覺到很驚奇,因為細菌是一些非常小的生物,能從外界吸收到的營養是非常少,並且它是非常簡單的動物,沒有必要保留這些多餘的基因序列,讓體積變得如此大,如此複雜。但是日本的科學家把這些細節記錄下來,並發表出來了。可見日本科學家是非常注重細節的,並且很願意共享出來。後面,一些別的科學家也發現這樣怪事的細菌。但是他們並不知道這些重複基因序列是幹什麼用的,以及為什麼要畫蛇添足地重複一段基因,是否細菌太傻了,太低階了,落後的表現?但是科學家們不管這個,先把這些重複的基因起一個名稱:“常間迴文重複序列叢集’’ (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats),簡稱“CRISPR”。這時總算把命名叫好了,以後大家見到這種現象的基因,就叫這個名稱,方便科學家進行分類,寫論文和開會討論。

不知道大家是否喜歡喝酸奶?我其實還是蠻喜歡喝像北京味道的酸奶,那種要用勺子挖來吃的感覺,吃入嘴裡入口即融化。其實這個世界上很多人喜歡喝酸奶,比如丹麥。在2005年一家丹麥公司正在生產酸奶,要生產酸奶就需要使用一種叫做嗜熱鏈球菌,用這種細菌來進行對牛奶進行轉化為酸奶,其實這個細菌專門吃牛奶裡的乳糖,然後排出乳酸。公司的生產情況有時候非常糟糕,本來把牛奶變成酸奶,但有時候變成的不是酸奶,而其它不能吃的奶。公司的領導決定派一個年輕的生物學家來查詢一下這個原因,一下子就找到了這個名叫做魯道夫·巴蘭古(Rodolphe Barrangou),這個小夥子受命於危難之際,對這項工作競競業業,每天加班地研究。他首先發現鏈球菌被一些噬細菌的病毒殺死了,導致牛奶變不成酸奶,牛奶裡只有噬菌體。他在想:原因是找到了,但是怎麼樣才能讓鏈球菌不被噬細菌殺死?領導已經不斷叫著“小巴,你的時間不多了,如果不解決就趕緊走人。”他日夜加班,就在他重複地做實驗時,有一天,他吃驚地發現在損壞的牛奶裡有一些鏈球菌,居然還活著,並且活得好好的,就是數量太少了,它們完全淹沒在噬細菌的海洋裡。山窮水盡疑無路之時,立即柳暗花明又一村。他突然分離幾個這樣的鏈球菌,把它放到顯微鏡下面,仔細一看,發現這些鏈球菌的DNA有一些重複的序列,這時他腦海裡聯絡到CRISPR,這不正是別的科學家發現重複的DNA怪問題嗎?一直沒有找到這段基因的作用,這時他明白了這段基因的作用,因為他發現這段怪異的基因是來源於入侵的病毒。鏈球菌其實是非常聰明,它把入侵的病毒一段基因插入到自己的DNA裡,並且在自己插入的位置兩頭做一個重複的標誌,記錄下來這個病毒曾經來攻擊它。其實就跟防毒軟體一樣,把軟體病毒的特徵碼寫入資料庫裡,當有發現這個特徵碼時,就發現這個軟體中毒了。鏈球菌做完這個工作之後,就跟電腦安裝了防毒軟體,因此鏈球菌也不怕這種病毒再次來攻擊了,我們把這種現象叫做免疫。不久,杜邦收購了巴蘭古供職的丹麥公司,並開始使用CRISPR來保護其所有酸奶和乾酪培養物。由於杜邦擁有全球乳製品市場50 %的份額,這意味著你可能已經在比薩上吃到過經CRISPR優化的乳酪了。

科學家們對巴蘭古的發現,總算認識到重複基因的作用,就是免疫作用,但是至於它們是怎麼樣免疫呢?於是科學家們又進入了新一輪的研究。在研究中發現了免疫的原理,具有免病的細菌,上面已經說了它會有那個病毒的DNA片段,當病毒再次來入侵時,細菌就會檢視病毒DNA片段是否在自己的DNA上找到,如果找到了,細菌就知道它是一個大壞蛋,於是細菌就拿起了自己的武器,產生一種特別的RNA的CRISPR associated protein 9酶,這種CAS9導彈,就會精確地打向病毒。為什麼說CAS9是導彈呢?因為CAS9有精準的定位功能,就像GPS一樣,它會搜尋細胞裡的DNA,如果發現其中一段與自己RNA上相同,那麼它就抓緊這段DNA,把這段DNA打壞,導致病毒不能再複製,因此病毒就會慢慢地死去。到這裡,科學家總算明白了免疫的原理了,其實跟殺病毒軟體一樣,發現軟體病毒的特徵碼,然後把所有軟體進行比較,如果是就把這個軟體間隔,不讓軟體執行起來。

其實到這裡,科學家們就可以回去睡大覺了,因為原理搞懂了,酸奶也可以正常生產了。但是總是有一些科學家閒得沒事做,總想到這個過程太完善了,可不可以把整個過程複製出來,應用到別的地方呢?好吧,好事的科學家又開始出發了。首先有科學家想到能否人工給一段假的RNA給CAS9酶,讓它去攻擊假RNA的病毒,科學家經過試驗,居然這樣還可行,把目標的DNA給剪開了。這樣的實驗發表出來之後,生物科學家在想,這種作用,不就是給我們提供了一把DNA的手術刀嗎?因此在生物界引起了巨大的反響,所有生物科學家都在研究這把手術刀能做什麼事情。有一些科學家開始拿老鼠來做實驗,把老鼠各種各樣的基因來剪斷,然後來觀察老鼠有什麼樣的問題。或者給老鼠種上HIV病毒,然後再使用CAS9來把這種病毒進行剪斷,再把老鼠醫好。在進行各種實驗之後,科學家還發現CAS9不但可以剪斷特定的DNA,還可以使用合適的酶來嵌入另外一段DNA到老鼠的DNA裡。

到這時,世界已經開始大量資本投入研究CAS9的導彈了。大家肯定就會把這種基因導彈使用到人的治療上,在一些癌症治療,就是把病人的基因測序,然後提出RNA,再把RNA和CAS9輸入病人裡,然後就可以對病毒細胞進行殺死了,簡稱為基因治序技術。CRISPR 技術有三大優點:高效、低價、可剪可插。如果這個技術成熟之後,治病成本會急劇降低。另外它解決一個目前沒有方法治療的基因病,比如色盲,色盲是可以一代一代傳下去的。以前教我的一個老師,他就是色盲,生活上非常麻煩,很多工作他是不能去做的。比如開車不行。在上課時,教室裡經常有三種顏色的粉筆,他看起來都是一樣的,經常要拿起來之後,問一下我們是什麼顏色,然後他才會開始在黑板上寫字,或者作標記。當同學碰到這時,總鬨笑一陣,總是慶幸自己不是色盲。如果採用CAS9的技術,進行基因編輯之後,他的後代就不會有這種麻煩了。

科學家也發現自然中有這樣一種生物,它是可以自修身體,比如蚯蚓,斷掉之後還會長出來。如果人嵌入這麼一段基因,斷掉一隻手,再可以重新長出來,斷掉一條腿也可以長出來。甚至肝切開之後,又可自己再長一個出來,這樣舊的器官不斷老化,新的器官不斷長出來,就可以達到長生不老了。

2018年11月26日,這一天註定是不平凡的一天,因為兩個基因人已經生出來了,人類終於來到自己給自己升級硬體的新時代。也希望這兩個基因人可以健康快樂地成長,你們的幸福註定了我們人類的未來,決定了一個2000年前的夢想:長生不老是否可以實現的方式,以及30億年之後人類是否可以走向深空的資本。

微控制器編譯器之連結器

https://edu.csdn.net/course/detail/8437

比特幣原始碼入門教程
https://edu.csdn.net/course/detail/6998
深入淺出Matplotlib
https://edu.csdn.net/course/detail/6859
深入淺出Numpy
http://edu.csdn.net/course/detail/6149 
Python遊戲開發入門
http://edu.csdn.net/course/detail/5690