在廣大粉絲的期待下，《生信寶典》聯合《巨集基因組》在2018年7月北京鼓樓推出《巨集基因組分析專題培訓》，大家提供一條走進生信大門的捷徑、為同行提供一個擴增子實戰分析學習和交流的機會、助力學員真正理解分析原理和完成實戰分析，獨創線下集中授課2天+自行練習5天+再集中講解答疑2天三段式教學，真正實現獨立分析大資料。

課程簡介

巨集基因組/微生物組是當今世界科研最熱門的研究領域之一，為加強本領域的技術交流與傳播，推動中國微生物組計劃發展，中科院青年科研人員創立“巨集基因組”公眾號，目標為打造本領域純乾貨技術及思想交流平臺。成立10個月關注人數近2萬，累計閱讀近2百萬次。

為滿足廣大讀者進一步學習的需求，現聯合《生信寶典》組織巨集基因組學專題培訓課程，進一步學習和交流巨集基因組學分析技術，手把手帶您快速入門、節約寶貴的時間，助力科研成果早日產出。

課程涉及主要內容如下：

一、巨集基因組學概述

1. 背景：國際微生物組、中國微生物組計劃
2. 研究物件：人、動物、植物、環境
3. 研究方法：培養組學、擴增子、巨集基因組、巨集轉錄組、巨集蛋白組、巨集代謝組、巨集基因組關聯分析、巨集表觀組……
4. 巨集基因組學的研究熱點：培養組、腸菌與疾病、MWAS……

二、巨集基因組測序原理和實驗設計

1. 測序基本原理
2. 腸道、環境、根系樣品製備、實驗重複和測序資料量的選擇
3. 正確設計實驗組與正/負對照
4. 樣品製作和建庫中的誤區、注意事項
5. 巨集基因組分析SCI文章的常用套路
6. 巨集基因組與擴增子優缺點比較

三、巨集基因常用結果解讀

1. 原始資料評估、組裝結果好壞的判斷
2. 基於基因丰度樣品、組間差異展示：相關性、PCA、PCoA、CCA等結果怎麼看
3. 差異KEEG及相關pathway通路圖結果
4. Cicos常用場景：基因拼接展示、分類功能基因來源分佈
5. 韋恩圖、三元圖展示三組及多組間相同與不同
6. 網路圖與分組、環境因子相關的意義

四、巨集基因分析流程講解及實戰

1. 實驗設計的編寫原則
2. HiSeq資料的質控：fastqc, Trimmomatic, MultiQC, khmer
3. 巨集基因組拼接：megahit, SPAdes
4. 拼接結果評估：quast
5. 基於kmer樣品和組間差異分析：sourmash
6. 基因註釋：Prokka、MetaGeneMark
7. 構建非冗餘基因集：cd-hit
8. 基因丰度估計：bowtie2, bwa, salmon等方法快速基因丰度定量，後續可進行PCA、PCoA、CCA等整體組間差異比較；也可進一步進行edgeR、metastat、Lefse進行組間差異基因分析；
9. 物種註釋：獲得非冗餘基因集物種註釋資訊，結合第8步丰度值可進行組間差異物種分析；
10. 基因功能分類註釋：代謝通路(KEGG)，同源基因簇(eggNOG)註釋，結果8中丰度進行組間差異功能比較；

五、高階分析與視覺化實戰

1. R語言統計繪圖與可重複計算
2. 巨集基因組中鑑定單菌(分箱bin)：Maxin, metabin
3. Bin結果評估及視覺化：CheckM, VizBin
4. 巨集基因組視覺化：Circos、Anvi’o
5. 有參巨集基因組分析：MetaPhlAn2、Humann2
6. 線上繪圖：METAGENassist
7. 線上流程：megan6、MG-RAST
8. 網路分析: igraph、WGCNA、Cytoscape

主講教師

主講老師包括中科院微生物所、遺傳發育所、基因組所、生物物理所等多名本領域一線技術專家。

助教團隊

十餘名科學院、清華、北大博士(含在讀)，輪值講師和助教，輔助學員學習和矯正培訓過程中不足的點。

培訓時間

2018-07-14 到 2018-07-15 (線下講解實戰)
2018-07-21 到 2018-07-22 (可線上線下同時，照顧不能長時間在北京的朋友)
每天早9點到晚5點，半封閉式教學
報到時間：開課前的週五晚上準備晚宴歡迎大家，促進相互認識和了解

授課地點

北京市西城區鼓樓明德大廈 (北京市舊鼓樓大街47號院2號樓2010)。

課程價格

1. 原價 6999 元/人，
   截止 2018-06-29 4199 元/人
   之後恢復原價6999元/人 (住宿自行解決，提供培訓期間午餐)
2. 名額有限，每次課程報名滿30人後自動關閉報名通道
3. 提供易漢博基因科技實習機會或工作機會

暑期促銷優惠活動

在2018年6月底前報名且成功繳費的使用者，不僅可以獲得上課的前排座位(座位按報名併成功繳費順序從前到後龍擺尾式排序)，更可同時享受如下四重優惠。

1. 贈送價值188元線上生信基礎課程一門，目前有《應用Python處理生物資訊資料和作圖》、《生物資訊作圖系列R、Cytoscape及圖形排版》和《轉錄組高階分析》和《生物資訊中的Linux應用》任選其一。
2. 獲贈32G品牌定製U盤 (內含資料資料)。
3. 多人(N，10>N>1)組團報名並同時繳費，每人還可獲得價值N百元的禮品(充值或購物卡)。
4. 零元學習588元微生物擴增子實戰分析，學員預先購買課程，待完成巨集基因組線下課程者，返現90%(10%被騰訊課堂扣除)。

*注意事項

1. 需自備膝上型電腦，系統不限(推薦使用Windows 10系統，8G記憶體更流暢)。課程實踐提供雲端計算平臺。
2. 培訓班所有資料，文件為內部資料，僅供參閱，未經允許不得翻印外傳登刊。
3. 上課期間禁止錄音，錄影。
4. 成功付款的學員，若臨時有緊急事情不能到來的，可申請延期，更換後續培訓班；也可申請退款。
5. 若開課2周 (含) 前申請退款可退還85%費用；開課3個工作日 (含) 前申請退款退還70%的費用。
6. 不可先延期再退款。

更多課程的詳細介紹，請掃描下方二維碼。

成為實驗中不可或缺的人，趕快報名吧！

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