利用scikitlearn畫ROC曲線
阿新 • • 發佈:2019-02-12
一個完整的資料探勘模型,最後都要進行模型評估,對於二分類來說,AUC,ROC這兩個指標用到最多,所以 利用sklearn裡面相應的函式進行模組搭建。
具體實現的程式碼可以參照下面博友的程式碼,評估svm的分類指標。注意裡面的一些細節需要注意,一個是呼叫roc_curve 方法時,指明目標標籤,否則會報錯。具體是這個引數的設定pos_label ,以前在unionbigdata實習時學到的。
重點是以下的程式碼需要根據實際改寫:
然後是博友的參考程式碼:mean_tpr = 0.0 mean_fpr = np.linspace(0, 1, 100) all_tpr = [] y_target = np.r_[train_y,test_y] cv = StratifiedKFold(y_target, n_folds=6) #畫ROC曲線和計算AUC fpr, tpr, thresholds = roc_curve(test_y, predict,pos_label = 2)##指定正例標籤,pos_label = ###########在數之聯的時候學到的,要制定正例 mean_tpr += interp(mean_fpr, fpr, tpr) #對mean_tpr在mean_fpr處進行插值,通過scipy包呼叫interp()函式 mean_tpr[0] = 0.0 #初始處為0 roc_auc = auc(fpr, tpr) #畫圖,只需要plt.plot(fpr,tpr),變數roc_auc只是記錄auc的值,通過auc()函式能計算出來 plt.plot(fpr, tpr, lw=1, label='ROC %s (area = %0.3f)' % (classifier, roc_auc))
- # -*- coding: utf-8 -*-
- """
- Created on Sun Apr 19 08:57:13 2015
- @author: shifeng
- """
- print(__doc__)
- import numpy as np
- from scipy import interp
- import matplotlib.pyplot as plt
- from sklearn import svm, datasets
- from sklearn.metrics import roc_curve, auc
-
from sklearn.cross_validation
- ###############################################################################
- # Data IO and generation,匯入iris資料,做資料準備
- # import some data to play with
- iris = datasets.load_iris()
- X = iris.data
- y = iris.target
- X, y = X[y != 2], y[y != 2]#去掉了label為2,label只能二分,才可以。
-
n_samples, n_features = X.shape
- # Add noisy features
- random_state = np.random.RandomState(0)
- X = np.c_[X, random_state.randn(n_samples, 200 * n_features)]
- ###############################################################################
- # Classification and ROC analysis
- #分類,做ROC分析
- # Run classifier with cross-validation and plot ROC curves
- #使用6折交叉驗證,並且畫ROC曲線
- cv = StratifiedKFold(y, n_folds=6)
- classifier = svm.SVC(kernel='linear', probability=True,
- random_state=random_state)#注意這裡,probability=True,需要,不然預測的時候會出現異常。另外rbf核效果更好些。
- mean_tpr = 0.0
- mean_fpr = np.linspace(0, 1, 100)
- all_tpr = []
- for i, (train, test) in enumerate(cv):
- #通過訓練資料,使用svm線性核建立模型,並對測試集進行測試,求出預測得分
- probas_ = classifier.fit(X[train], y[train]).predict_proba(X[test])
- # print set(y[train]) #set([0,1]) 即label有兩個類別
- # print len(X[train]),len(X[test]) #訓練集有84個,測試集有16個
- # print "++",probas_ #predict_proba()函式輸出的是測試集在lael各類別上的置信度,
- # #在哪個類別上的置信度高,則分為哪類
- # Compute ROC curve and area the curve
- #通過roc_curve()函式,求出fpr和tpr,以及閾值
- fpr, tpr, thresholds = roc_curve(y[test], probas_[:, 1])
- mean_tpr += interp(mean_fpr, fpr, tpr) #對mean_tpr在mean_fpr處進行插值,通過scipy包呼叫interp()函式
- mean_tpr[0] = 0.0#初始處為0
- roc_auc = auc(fpr, tpr)
- #畫圖,只需要plt.plot(fpr,tpr),變數roc_auc只是記錄auc的值,通過auc()函式能計算出來
- plt.plot(fpr, tpr, lw=1, label='ROC fold %d (area = %0.2f)' % (i, roc_auc))
- #畫對角線
- plt.plot([0, 1], [0, 1], '--', color=(0.6, 0.6, 0.6), label='Luck')
- mean_tpr /= len(cv) #在mean_fpr100個點,每個點處插值插值多次取平均
- mean_tpr[-1] = 1.0#座標最後一個點為(1,1)
- mean_auc = auc(mean_fpr, mean_tpr) #計算平均AUC值
- #畫平均ROC曲線
- #print mean_fpr,len(mean_fpr)
- #print mean_tpr
- plt.plot(mean_fpr, mean_tpr, 'k--',
- label='Mean ROC (area = %0.2f)' % mean_auc, lw=2)
- plt.xlim([-0.05, 1.05])
- plt.ylim([-0.05, 1.05])
- plt.xlabel('False Positive Rate')
- plt.ylabel('True Positive Rate')
- plt.title('Receiver operating characteristic example')
- plt.legend(loc="lower right")
- plt.show()