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利用scikitlearn畫ROC曲線

一個完整的資料探勘模型,最後都要進行模型評估,對於二分類來說,AUCROC這兩個指標用到最多,所以 利用sklearn裡面相應的函式進行模組搭建。

具體實現的程式碼可以參照下面博友的程式碼,評估svm的分類指標。注意裡面的一些細節需要注意,一個是呼叫roc_curve 方法時,指明目標標籤,否則會報錯。具體是這個引數的設定pos_label ,以前在unionbigdata實習時學到的。

重點是以下的程式碼需要根據實際改寫:

    mean_tpr = 0.0  
    mean_fpr = np.linspace(0, 1, 100)  
    all_tpr = []
    
    y_target = np.r_[train_y,test_y]
    cv = StratifiedKFold(y_target, n_folds=6)

        #畫ROC曲線和計算AUC
        fpr, tpr, thresholds = roc_curve(test_y, predict,pos_label = 2)##指定正例標籤,pos_label = ###########在數之聯的時候學到的,要制定正例
        
        mean_tpr += interp(mean_fpr, fpr, tpr)          #對mean_tpr在mean_fpr處進行插值,通過scipy包呼叫interp()函式  
        mean_tpr[0] = 0.0                               #初始處為0  
        roc_auc = auc(fpr, tpr)  
        #畫圖,只需要plt.plot(fpr,tpr),變數roc_auc只是記錄auc的值,通過auc()函式能計算出來  
        plt.plot(fpr, tpr, lw=1, label='ROC  %s (area = %0.3f)' % (classifier, roc_auc)) 
然後是博友的參考程式碼:

  1. # -*- coding: utf-8 -*-
  2. """ 
  3. Created on Sun Apr 19 08:57:13 2015 
  4. @author: shifeng 
  5. """
  6. print(__doc__)  
  7. import numpy as np  
  8. from scipy import interp  
  9. import matplotlib.pyplot as plt  
  10. from sklearn import svm, datasets  
  11. from sklearn.metrics import roc_curve, auc  
  12. from sklearn.cross_validation 
    import StratifiedKFold  
  13. ###############################################################################
  14. # Data IO and generation,匯入iris資料,做資料準備
  15. # import some data to play with
  16. iris = datasets.load_iris()  
  17. X = iris.data  
  18. y = iris.target  
  19. X, y = X[y != 2], y[y != 2]#去掉了label為2,label只能二分,才可以。
  20. n_samples, n_features = X.shape  
  21. # Add noisy features
  22. random_state = np.random.RandomState(0)  
  23. X = np.c_[X, random_state.randn(n_samples, 200 * n_features)]  
  24. ###############################################################################
  25. # Classification and ROC analysis
  26. #分類,做ROC分析
  27. # Run classifier with cross-validation and plot ROC curves
  28. #使用6折交叉驗證,並且畫ROC曲線
  29. cv = StratifiedKFold(y, n_folds=6)  
  30. classifier = svm.SVC(kernel='linear', probability=True,  
  31.                      random_state=random_state)#注意這裡,probability=True,需要,不然預測的時候會出現異常。另外rbf核效果更好些。
  32. mean_tpr = 0.0
  33. mean_fpr = np.linspace(01100)  
  34. all_tpr = []  
  35. for i, (train, test) in enumerate(cv):  
  36.     #通過訓練資料,使用svm線性核建立模型,並對測試集進行測試,求出預測得分
  37.     probas_ = classifier.fit(X[train], y[train]).predict_proba(X[test])  
  38. #    print set(y[train])                     #set([0,1]) 即label有兩個類別
  39. #    print len(X[train]),len(X[test])        #訓練集有84個,測試集有16個
  40. #    print "++",probas_                      #predict_proba()函式輸出的是測試集在lael各類別上的置信度,
  41. #    #在哪個類別上的置信度高,則分為哪類
  42.     # Compute ROC curve and area the curve
  43.     #通過roc_curve()函式,求出fpr和tpr,以及閾值
  44.     fpr, tpr, thresholds = roc_curve(y[test], probas_[:, 1])  
  45.     mean_tpr += interp(mean_fpr, fpr, tpr)          #對mean_tpr在mean_fpr處進行插值,通過scipy包呼叫interp()函式
  46.     mean_tpr[0] = 0.0#初始處為0
  47.     roc_auc = auc(fpr, tpr)  
  48.     #畫圖,只需要plt.plot(fpr,tpr),變數roc_auc只是記錄auc的值,通過auc()函式能計算出來
  49.     plt.plot(fpr, tpr, lw=1, label='ROC fold %d (area = %0.2f)' % (i, roc_auc))  
  50. #畫對角線
  51. plt.plot([01], [01], '--', color=(0.60.60.6), label='Luck')  
  52. mean_tpr /= len(cv)                     #在mean_fpr100個點,每個點處插值插值多次取平均
  53. mean_tpr[-1] = 1.0#座標最後一個點為(1,1)
  54. mean_auc = auc(mean_fpr, mean_tpr)      #計算平均AUC值
  55. #畫平均ROC曲線
  56. #print mean_fpr,len(mean_fpr)
  57. #print mean_tpr
  58. plt.plot(mean_fpr, mean_tpr, 'k--',  
  59.          label='Mean ROC (area = %0.2f)' % mean_auc, lw=2)  
  60. plt.xlim([-0.051.05])  
  61. plt.ylim([-0.051.05])  
  62. plt.xlabel('False Positive Rate')  
  63. plt.ylabel('True Positive Rate')  
  64. plt.title('Receiver operating characteristic example')  
  65. plt.legend(loc="lower right")  
  66. plt.show()