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2018.10.31 作業八

1.用python實現K均值演算法

K-means是一個反覆迭代的過程,演算法分為四個步驟:

  (x,k,y)

1) 選取資料空間中的K個物件作為初始中心,每個物件代表一個聚類中心;

  def initcenter(x, k): kc

2) 對於樣本中的資料物件,根據它們與這些聚類中心的歐氏距離,按距離最近的準則將它們分到距離它們最近的聚類中心(最相似)所對應的類;

  def nearest(kc, x[i]): j

  def xclassify(x, y, kc):y[i]=j

3) 更新聚類中心:將每個類別中所有物件所對應的均值作為該類別的聚類中心,計算目標函式的值;

  def kcmean(x, y, kc, k):

4) 判斷聚類中心和目標函式的值是否發生改變,若不變,則輸出結果,若改變,則返回2)。

  while flag:

      y = xclassify(x, y, kc)

      kc, flag = kcmean(x, y, kc, k)

 

4. 鳶尾花完整資料做聚類並用散點圖顯示.

 

import numpy as np
x = np.random.randint(1,100,[20,1])
y = np.zeros(20)
k = 3

#1) 選取資料空間中的K個物件作為初始中心,每個物件代表一個聚類中心
def initcenter(x,k):
    return x[:k].reshape(k)

#2) 對於樣本中的資料物件,根據它們與這些聚類中心的歐氏距離,按距離最近的準則將它們分到距離它們最近的聚類中心(最相似)所對應的類
def nearest(kc,i):
    d = abs(kc-i)
    w = np.where(d == np.min(d))
    return w[0][0]

#用for迴圈遍歷,把隨機陣列自動劃分到與它距離最近的類,返回類的下標y
def xclassify(x,y,kc):
    for i in range(x.shape[0]):
        y[i] = nearest(kc,x[i])
        return y
    
#3) 更新聚類中心:將每個類別中所有物件所對應的均值作為該類別的聚類中心,計算目標函式的值
def kcmean(x,y,kc,k):
    l = list(kc)
    flag = False
    for c in range(k):
        m = np.where(y==c)
        if m[0].shape != (0,):
            n = np.mean(x[m])
        if l[c] != n:
            l[c] = n
            flag = True           
    return(np.array(l),flag)

#4) 判斷聚類中心和目標函式的值是否發生改變,若不變,則輸出結果,若改變,則返回2
kc = initcenter(x,k)
flag = True
print(x,y,kc,flag)
while flag:
    y = xclassify(x,y,kc)
    kc,flag = kcmean(x,y,kc,k)
print(y,kc)

  執行結果:

 

2. 鳶尾花花瓣長度資料做聚類並用散點圖顯示

import matplotlib.pyplot as plt
plt.scatter(x,x,c=x,s=50,cmap="rainbow");
plt.show()

  執行結果:

 

3. 用sklearn.cluster.KMeans,鳶尾花花瓣長度資料做聚類並用散點圖顯示

from sklearn.cluster import KMeans

import numpy as np

from sklearn.datasets import load_iris  

import matplotlib.pyplot as plt

data = load_iris()

iris = data.data

petal_len = iris[:,2:3]

print(petal_len)

k_means = KMeans(n_clusters=3) #三個聚類中心

result = k_means.fit(petal_len) #Kmeans自動分類

kc = result.cluster_centers_ #自動分類後的聚類中心

y_means = k_means.predict(petal_len) #預測Y值

plt.scatter(petal_len,np.linspace(1,150,150),c=y_means,marker='x')

plt.show()

  執行結果:

 

4. 鳶尾花完整資料做聚類並用散點圖顯示

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
from sklearn.datasets import load_iris

iris = load_iris()
X = iris.data
X

from sklearn.cluster import KMeans

est = KMeans(n_clusters = 3)
est.fit(X)
kc = est.cluster_centers_
y_kmeans = est.predict(X)   #預測每個樣本的聚類索引

print(y_kmeans,kc)
print(kc.shape,y_kmeans.shape,np.shape)

plt.scatter(X[:,0],X[:,1],c=y_kmeans,s=50,cmap='rainbow');
plt.show()

  執行結果: