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生物資訊學分析常用網站

1.  BLAST(核酸蛋白序列比對):

https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

2.  miRBasemiRNA資料庫網站):

http://www.mirbase.org/

3.  PlantCARE(啟動子元件分析網站):

    http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/

4.  Weblogo(核酸蛋白序列位點保守性分析):

http://weblogo.berkeley.edu/logo.cgi

5.  CBS Prediction Servers(綜合分析,強烈推薦)

http://www.cbs.dtu.dk/services/

其中比較常用的有:

     Promoter 2.0 Prediction Server(轉錄起始位點預測)

http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/

SignalP 4.1 Server(訊號肽預測)

http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/

  TargetP 1.1 Server(亞細胞定位預測)

http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/

  TMHMM Server v.2.0(蛋白跨膜結構預測)

http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/

6.  SWISS-MODEL(蛋白三維建模)

https://swissmodel.expasy.org/

7.  RNA22miRNA靶基因預測)

https://cm.jefferson.edu/rna22/

8.  PDB(蛋白質資料庫)

http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

9. 

 RNAfold web serverRNA二級結構預測)

http://nhjy.hzau.edu.cn/kech/swxxx/jakj/dianzi/Bioinf4/miRNA/miRNA1.htm

10.TAIR(擬南芥資料庫)

http://www.arabidopsis.org/

11.文獻搜尋(農大沒有版權的文獻下載)

http://www.sci-hub.cc/

12.生物序列的視覺化示意圖製作(IBS

http://ibs.biocuckoo.org/

13.InterPro(蛋白質序列分析)

http://www.ebi.ac.uk/interpro/

14.RNA結合蛋白預測

RNA binding motif (RRM) containing

http://www.genenames.org/genefamilies/RBM

RBPmap

http://rbpmap.technion.ac.il/

RNApred

http://www.imtech.res.in/raghava/rnapred/help.html