一、配置conda環境（進入cutadapt環境）

1 conda activate cutadapt

不會安裝conda和用conda安裝cutadapt可以參考一下我前兩篇隨筆：

https://www.cnblogs.com/zengy-bioinfostudy/p/14914828.html

https://www.cnblogs.com/zengy-bioinfostudy/p/14929008.html

或者其它部落格或者直接找官網文件。

二、安裝blast工具

進入ncbi下載blast本地工具的下載站：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/

選擇linux版本的.tar.gz檔案，下載到本地，然後用xftp或其它你喜歡用的工具上傳到你的伺服器上

進入linux伺服器，cd到你上傳檔案的目錄

給檔案加個可執行許可權，然後tar解壓

1 sudo chmod +x ncbi-blast-2.11.0+-x64-linux.tar.gz
2 
3 tar -zxvf ncbi-blast-2.11.0+-x64-linux.tar.gz

把安裝目錄新增進$PATH下：

1 vim ~/.bashrc

在最後一行新增：

1 export PATH=/解壓後的資料夾的路徑/ncbi-blast-2.11.0+/bin:$PATH 

我這裡是放在了自己家目錄下，畢竟我用的不是root使用者安裝的（狗頭）

檢查blast命令是否正常：

命令列鍵入blast，如果彈出如下介面，說明工作正常：

詳細使用說明可以參考這位大佬的知乎：

https://zhuanlan.zhihu.com/p/141644734

三、安裝biom工具

劉永鑫老師我覺得是講的很詳細了，這裡我就不再贅述了：

https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/84678543

四、獲取vsearch工具

其實這個應該用官方給的方法安裝的，但是我的系統老是在make的時候出錯，找了半天找不到解決方法，於是就直接用了可執行檔案，安裝的方法請參考官方github網站：

https://github.com/torognes/vsearch

我的獲取方法是在github的發行版本那下載對應版本的可執行檔案然後上傳到伺服器上，最後新增進$PATH下（新增方法上面安裝blast的時候有提到，這裡不提了）

https://github.com/torognes/vsearch/releases

OK，到這裡，所有我們需要的工具就全部安裝完成了！！蕪湖！！！

接下來，就可以愉快的開始分析擴增子資料嘍！！！（雖然我還沒學會各個工具的使用方法）